Με τον Ζοζέ Πεσέιρο στον πάγκο ο Παναθηναϊκός τερμάτισε τρίτος στην κανονική περίοδο και πρώτος στα play-offs, χωρίς ήττα σε έξι αγώνες, κερδίζοντας τη θέση στα προκριματικά του Champions League. Στο Κύπελλο UEFA πέρασε από τον όμιλο ως δεύτερος και αποκλείστηκε από τη Ρέιντζερς με το εκτός έδρας γκολ. Στο Κύπελλο Ελλάδας ηττήθηκε 4-0 από τον Ολυμπιακό στη φάση των 16.
16 ομάδες, διπλός γύρος (30 αγωνιστικές) και play-offs 4 ομάδων (θέσεις 2-5) για την ευρωπαϊκή έξοδο
| # | Ομάδα | Β | Γκολ |
|---|---|---|---|
| 1 | Ολυμπιακός | 70 | 58:23 |
| 2 | ΑΕΚ | 68 | 65:17 |
| 3 | Παναθηναϊκός | 66 | 44:18 |
| 4 | Άρης | 50 | 33:20 |
| 5 | Πανιώνιος | 45 | 39:42 |
Κανονική περίοδος. Play-offs: 1η θέση (κατάταξη «2η» συνολικά), 6 αγ. 4-2-0, 14-5, 21 β. (περιλαμβάνει 7 βαθμούς μπόνους) → 3ος προκριματικός Champions League.
Φάση των 16
Φάση των 32 · αποκλεισμός με εκτός έδρας γκολ (1-1)
Με τρεις νίκες σε τέσσερις αγώνες ο Παναθηναϊκός πέρασε στη φάση των 32 του Κυπέλλου UEFA ως δεύτερος.
Μετά το 0-0 της Γλασκώβης, το 1-1 στην Αθήνα έδωσε την πρόκριση στη Ρέιντζερς.
Τέσσερις νίκες και δύο ισοπαλίες χάρισαν την πρώτη θέση των play-offs και το εισιτήριο για τα προκριματικά του Champions League.
Μερικό ρόστερ: μόνο παίκτες που τεκμηριώνονται από πηγή. Συμμετοχές και γκολ: μόνο πρωτάθλημα, εκτός αν σημειώνεται.
| Αρ. | Παίκτης | Γραμμή | Συμμ. | Γκολ | Σημείωση |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Μάριο Γκαλίνοβιτς | ΤΕΡ | — | — | |
| 18 | Αρκάντιους Μάλαρζ | ΤΕΡ | — | — | |
| 33 | Ορέστης Καρνέζης | ΤΕΡ | — | — | |
| 2 | Τζόζεφ Ενακαρίρε | ΑΜΥ | — | — | |
| 3 | Χόσου Σαριέγκι | ΑΜΥ | — | — | |
| 5 | Νασίφ Μόρις | ΑΜΥ | — | — | |
| 6 | Φίλιππος Δάρλας | ΑΜΥ | — | — | |
| 8 | Γιάννης Γκούμας | ΑΜΥ | — | — | αρχηγός |
| 15 | Τάκης Φύσσας | ΑΜΥ | — | — | |
| 19 | Άντονι Σέριτς | ΑΜΥ | — | — | |
| 23 | Σιμάο Ματέ Τζούνιορ | ΑΜΥ | — | — | |
| 24 | Λουκάς Βύντρα | ΑΜΥ | — | — | |
| 29 | Μίκαελ Νίλσον | ΑΜΥ | — | — | |
| 31 | Νίκος Σπυρόπουλος | ΑΜΥ | — | — | |
| 4 | Μαρσέλο Μάτος | ΜΕΣ | — | — | |
| 7 | Σωτήρης Νίνης | ΜΕΣ | — | — | |
| 9 | Σεμπαστιάν Ρομέρο | ΜΕΣ | — | — | |
| 10 | Εσεκιέλ Γκονζάλες | ΜΕΣ | — | — | |
| 20 | Σωτήρης Λεοντίου | ΜΕΣ | — | — | |
| 21 | Γιώργος Καραγκούνης | ΜΕΣ | — | — | |
| 22 | Αλέξανδρος Τζιόλης | ΜΕΣ | — | — | |
| 27 | Αντρέας Ιβάνσιτς | ΜΕΣ | — | — | |
| 30 | Ελίνι Ντιμούτσος | ΜΕΣ | — | — | |
| 11 | Δημήτρης Παπαδόπουλος | ΕΠΙ | — | — | |
| 12 | Έλντερ Ποστίγκα | ΕΠΙ | — | — | δανεικός από την Πόρτο |
| 14 | Δημήτρης Σαλπιγγίδης | ΕΠΙ | — | 15 | |
| 25 | Νταμ Εντόγε | ΕΠΙ | — | — | |
| 26 | Βαγγέλης Μάντζιος | ΕΠΙ | — | — | |
| 36 | Μανούτσο | ΕΠΙ | — | — | δανεικός από τη Μάντσεστερ Γιουνάιτεντ |
* όλες οι διοργανώσεις (δεν υπάρχει ξεχωριστό στοιχείο πρωταθλήματος).